Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PIAS3Q9Y6X2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PIAS3Q9Y6X2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms