Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP8AP2Q9UKL3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP8AP2Q9UKL3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms