Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
MRTO4Q9UKD2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
MRTO4Q9UKD2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms