Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF56

FBXL17, F-box/LRR-repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXL17Q9UF56 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FBXL17Q9UF56 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms