Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PDP1Q9P0J1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDP1Q9P0J1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms