Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
MS4A12Q9NXJ0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms