Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ZNF275Q9NSD4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ZNF275Q9NSD4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms