Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAT1LQ9HCJ6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAT1LQ9HCJ6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms