Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
USP44Q9H0E7 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
USP44Q9H0E7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms