Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM5Q9C035 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms