Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RSPO3Q9BXY4 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RSPO3Q9BXY4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms