Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BRIP1Q9BX63 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRIP1Q9BX63 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms