Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
LPIN3Q9BQK8 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LPIN3Q9BQK8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms