Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RETNLBQ9BQ08 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms