Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NUDCD1Q96RS6 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms