Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SCLT1Q96NL6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCLT1Q96NL6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms