Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CNBD2Q96M20 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms