Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
RNFT2Q96EX2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RNFT2Q96EX2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms