Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC102AQ96A19 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC102AQ96A19 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms