Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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UBXN4Q92575 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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UBXN4Q92575 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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UBXN4Q92575 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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UBXN4Q92575 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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UBXN4Q92575 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
UBXN4Q92575 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
UBXN4Q92575 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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