Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KLHDC4Q8TBB5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHDC4Q8TBB5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms