Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9W5

DNAAF3, Dynein assembly factor 3, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF3Q8N9W5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DNAAF3Q8N9W5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DNAAF3Q8N9W5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms