Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SVOPQ8N4V2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SVOPQ8N4V2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms