Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NUP54Q7Z3B4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUP54Q7Z3B4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms