Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC24A5Q71RS6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms