Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNIP4Q6PIL6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms