Protein–RNA interactions for Protein: Q5SR53

PIK3CD-AS1, Putative uncharacterized protein PIK3CD-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PIK3CD-AS1Q5SR53 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PIK3CD-AS1Q5SR53 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms