Protein–RNA interactions for Protein: Q569G3

C5orf47, Uncharacterized protein C5orf47, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf47Q569G3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
C5orf47Q569G3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms