Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HSD17B12Q53GQ0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms