Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DUSP28Q4G0W2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DUSP28Q4G0W2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms