Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RNF212Q495C1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RNF212Q495C1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms