Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TRIM71Q2Q1W2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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