Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ODF4Q2M2E3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms