Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LAMA4Q16363 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LAMA4Q16363 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
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