Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NEDD8Q15843 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NEDD8Q15843 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms