Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HMGN3Q15651 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HMGN3Q15651 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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