Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NCF4Q15080 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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