Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TRAM2Q15035 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRAM2Q15035 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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