Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SMC1AQ14683 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SMC1AQ14683 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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