Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CCINQ13939 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCINQ13939 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCINQ13939 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCINQ13939 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
CCINQ13939 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCINQ13939 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms