Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKP1Q13835 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKP1Q13835 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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