Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CUL3Q13618 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CUL3Q13618 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms