Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IRF5Q13568 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IRF5Q13568 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms