Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SP140Q13342 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SP140Q13342 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SP140Q13342 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SP140Q13342 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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SP140Q13342 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SP140Q13342 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SP140Q13342 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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