Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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SEMA3BQ13214 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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SEMA3BQ13214 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEMA3BQ13214 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
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