Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CALCOCO2Q13137 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CALCOCO2Q13137 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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