Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAF3Q13114 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms