Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNMA1Q12791 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
KCNMA1Q12791 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
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