Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DSC1Q08554 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
DSC1Q08554 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms