Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4DQ08499 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms